Ban Chỉ đạo Cải cách hành chính tỉnh Kon Tum, gồm Trưởng Ban Chỉ đạo là Chủ tịch Ủy ban nhân dân tỉnh. Các Phó Trưởng Ban Chỉ đạo là Phó Chủ tịch Ủy ban nhân dân tỉnh phụ trách khối văn hóa xã hội, Phó Trưởng ban thứ nhất; Phó Chủ tịch Ủy ban nhân dân tỉnh phụ trách khối kinh tế tổng hợp, Phó Trưởng ban thứ hai; Giám đốc Sở Nội vụ, Phó Trưởng ban Thường trực và các Ủy viên Ban chỉ đạo.

Sở Nội vụ là cơ quan thường trực của Ban Chỉ đạo, có trách nhiệm bảo đảm các điều kiện hoạt động của Ban Chỉ đạo; sử dụng các đơn vị thuộc, trực thuộc liên quan để thực hiện các nhiệm vụ của Ban Chỉ đạo; chủ trì, phối hợp với các thành viên Ban chỉ đạo tham mưu Trưởng ban ban hành Quy chế làm việc của Ban Chỉ đạo. Ban Chỉ đạo được sử dụng con dấu của Ủy ban nhân dân tỉnh khi Trưởng ban, Phó Trưởng ban thứ nhất, Phó Trưởng ban thứ hai ký; Phó Trưởng ban thường trực được sử dụng con dấu của cơ quan khi ký để thực hiện nhiệm vụ, quyền hạn của Ban Chỉ đạo.

Ban Chỉ đạo có chức năng giúp Chủ tịch Ủy ban nhân dân tỉnh chỉ đạo, phối hợp, tổ chức thực hiện các nhiệm vụ về cải cách hành chính theo chương trình, kế hoạch của Chính phủ, Tỉnh ủy, Hội đồng nhân dân tỉnh, Ủy ban nhân dân tỉnh.

Ban Chỉ đạo có nhiệm vụ Nghiên cứu, đề xuất các chủ trương, chính sách và giải pháp quan trọng để đẩy mạnh công tác cải cách hành chính tỉnh; cho ý kiến đối với các dự thảo đề án, quyết định, chỉ thị, chương trình, kế hoạch thực hiện công tác cải cách hành chính hằng năm và trong từng giai đoạn của tỉnh trước khi trình cấp có thẩm quyền. Tham mưu, giúp Ủy ban nhân dân tỉnh chỉ đạo, hướng dẫn, đôn đốc, kiểm tra, phối hợp với các sở, ban, ngành, Ủy ban nhân dân các huyện, thành phố thực hiện các nghị quyết của Chính phủ, chủ trương của Tỉnh ủy, Hội đồng nhân dân tỉnh; quyết định, chỉ thị, chương trình, kế hoạch cải cách hành chính giai đoạn, hằng năm của Ủy ban nhân dân tỉnh và các văn bản chỉ đạo liên quan đến công tác cải cách hành chính. Xem xét, cho ý kiến những vấn đề phức tạp phát sinh trong quá trình triển khai thực hiện các lĩnh vực, nhiệm vụ công tác cải cách hành chính.Thực hiện nhiệm vụ khác theo sự phân công của cấp có thẩm quyền.