Theo đó, Sở Tài chính là cơ quan chuyên môn thuộc Ủy ban nhân dân tỉnh, thực hiện chức năng tham mưu, giúp Ủy ban nhân dân tỉnh quản lý nhà nước về tài chính; ngân sách nhà nước; thuế, phí, lệ phí và thu khác của ngân sách nhà nước; tài sản nhà nước; các quỹ tài chính nhà nước; đầu tư tài chính; tài chính doanh nghiệp; kế toán; kiểm toán độc lập; lĩnh vực giá và các hoạt động dịch vụ tài chính tại địa phương theo quy định của pháp luật. Sở Tài chính có tư cách pháp nhân, có con dấu và tài khoản riêng; chịu sự chỉ đạo, quản lý về tổ chức và hoạt động của Ủy ban nhân dân tỉnh; đồng thời chịu sự chỉ đạo, hướng dẫn, thanh tra, kiểm tra về chuyên môn, nghiệp vụ của Bộ Tài chính.
Nhiệm vụ và quyền hạn của Sở Tài chính thực hiện theo quy định tại Điều 2 Thông tư liên tịch số 220/2015/TTLT-BTC-BNV ngày 31 tháng 12 năm 2015 của Bộ trưởng Bộ Tài chính, Bộ trưởng Bộ Nội vụ; Cơ cấu tổ chức của Sở gồm có: Giám đốc và không quá 03 (ba) Phó Giám đốc; các phòng chuyên môn, nghiệp vụ gồm: Văn phòng, Thanh tra, Phòng Quản lý ngân sách, Phòng Tài chính đầu tư, Phòng Tài chính hành chính sự nghiệp, Phòng Tài chính Doanh nghiệp, Phòng quản lý Giá và Công sản, Phòng Tin học và Thống kê (Trước mắt chưa thành lập Phòng Tài chính hành chính sự nghiệp và Phòng Tin học và Thống kê); Biên chế công chức của Sở Tài chính được giao trên cơ sở vị trí việc làm, gắn với chức năng, nhiệm vụ, phạm vi hoạt động và nằm trong tổng số biên chế công chức trong các cơ quan, tổ chức hành chính của tỉnh được cấp có thẩm quyền giao hoặc phê duyệt.
Quyết định còn quy định việc thành lập, chia tách, sáp nhập, giải thể các đơn vị thuộc Sở Tài chính; Việc bổ nhiệm, bổ nhiệm lại, miễn nhiệm, điều động, luân chuyển, khen thưởng, kỷ luật, cho từ chức, nghỉ hưu và thực hiện chế độ, chính sách khác đối với công chức của Sở Tài chính; quy định nhiệm vụ, quyền hạn của Giám đốc và các Phó Giám đốc; chế làm làm việc và mối quan hệ công tác...
Quyết định này có hiệu lực thi hành kể từ ngày 17/11/2016 và thay thế Quyết định số 52/2009/QĐ-UBND ngày 10 tháng 9 năm 2009 của Ủy ban nhân dân tỉnh Kon Tum về việc ban hành quy định về chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Sở Tài chính tỉnh Kon Tum.
Cũng trong ngày 08/11/2016, Chủ tịch Ủy ban nhân dân tỉnh đã ban hành Quyết định số 578/QĐ-UBND thành lập các tổ chức tham mưu tổng hợp và chuyên môn nghiệp vụ thuộc Sở Tài chính tỉnh Kon Tum. Theo đó, thành lập 06 tổ chức tham mưu tổng hợp và chuyên môn nghiệp vụ gồm: Văn phòng; Thanh tra; Phòng Quản lý ngân sách; Phòng Tài chính đầu tư; Phòng Tài chính doanh nghiệp; Phòng Quản lý Giá và Công sản. Giao Giám đốc Sở Tài chính quy định cụ thể chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của các đơn vị thuộc Sở theo quy định; tạm thời bố trí nhiệm vụ quản lý Tài chính hành chính sự nghiệp và Tin học, Thống kê cho Phòng Quản lý ngân sách đến khi đủ điều kiện thành lập các đơn vị mới.