Tại Quyết định số 555/QĐ-UBND ngày 21/10/2016, Chủ tịch UBND tỉnh thành lập 07 tổ chức tham mưu tổng hợp và chuyên môn, nghiệp vụ thuộc Sở Y tế, gồm: Văn phòng, Thanh tra, Phòng Tổ chức cán bộ, Phòng Nghiệp vụ Y, Phòng Nghiệp vụ Dược, Phòng Kế hoạch - Tài chính và Phòng Quản lý hành nghề y dược tư nhân. Giao Giám đốc Sở Y tế quy định cụ thể chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của các tổ chức này theo quy định.

Tại Quyết định số 553/QĐ-UBND ngày 21/10/2016, Chủ tịch UBND tỉnh đổi tên Bệnh viện Y học cổ truyền thành Bệnh viện Y dược cổ truyền trực thuộc Sở Y tế; tại Quyết định số 554/QĐ-UBND ngày 21/10/2016, đổi tên Trung tâm Kiểm nghiệm thành Trung tâm Kiểm nghiệm thuốc, mỹ phẩm, thực phẩm trực thuộc Sở Y; tại Quyết định số 557/QĐ-UBND ngày 21/10/2016, đổi tên Trường Trung học Y tế thành Trường Trung cấp Y tế trực thuộc Sở Y tế. Việc đổi tên các đơn vị này để phù hợp với quy định tại Thông tư liên tịch số 51/2015/TTLT-BYT-BNV ngày 11/12/2015 của Bộ trưởng Bộ Y tế - Bộ trưởng Bộ Nội vụ và Quyết định số 43/2016/QĐ-UBND ngày 21/6/2016 của UBND tỉnh Kon Tum.

Theo Quyết định số 556/QĐ-UBND ngày 21/10/2016 về việc tổ chức lại Trung tâm Pháp y trực thuộc Sở Y tế tỉnh Kon Tum, cụ thể: Trung tâm Pháp y tỉnh Kon Tum là đơn vị sự nghiệp y tế công lập có thu trực thuộc Sở Y tế, có tư cách pháp nhân, có trụ sở, có con dấu và tài khoản riêng; Trung tâm tổ chức thực hiện chức năng giám định pháp y, nghiên cứu khoa học và tham gia đào tạo, đào tạo bồi dưỡng trong lĩnh vực pháp y trên địa bàn tỉnh. Trung tâm thực hiện nhiệm vụ, quyền hạn theo quy định tại Điều 4 và Điều 5 Thông tư số 42/2015/TT-BYT ngày 16/11/2015 của Bộ trưởng Bộ Y tế. Trung tâm Pháp y có lãnh đạo Trung tâm (Giám đốc và không quá 02 Phó Giám đốc), 02 phòng chức năng và 03 khoa chuyên môn; biên chế của Trung tâm là biên chế sự nghiệp được cấp có thẩm quyền giao và nằm trong tổng số biên chế sự nghiệp của Sở Y tế. Quyết định này có hiệu lực kể từ ngày ký và thay thế Quyết định số 596/QĐ-UBND ngày 04/11/2015 của Chủ tịch UBND tỉnh về việc thành lập Trung tâm Pháp y./.