Theo quy định, cơ cấu tổ chức của Quỹ PCTT tỉnh bao gồm: Cơ quan Thường trực Ban Chỉ huy Phòng, chống thiên tai và tìm kiếm cứu nạn (Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn) giúp UBND tỉnh trong công tác quản lý hoạt động của Quỹ; Cơ quan quản lý gồm có: Giám đốc, Phó Giám đốc, Kế toán và bộ phận giúp việc (Giám đốc Quỹ là Phó Giám đốc Sở NN-PTNT - Chánh Văn phòng Ban Chỉ huy PCTT và tìm kiếm cứu nạn tỉnh; Phó Giám đốc Quỹ là Phó Chánh Văn phòng Ban Chỉ huy PCTT và tìm kiếm cứu nạn tỉnh; Kế toán và bộ phận giúp việc được sử dụng nhân lực của Văn phòng Ban Chỉ huy PCTT và tìm kiếm cứu nạn tỉnh, làm việc theo chế độ kiêm nhiệm). Trụ sở làm việc của Quỹ đặt tại Văn phòng Ban Chỉ huy PCTT và tìm kiếm cứu nạn tỉnh.
UBND tỉnh ủy quyền UBND cấp huyện tổ chức thu Quỹ các đối tượng được quy định tại khoản 1, khoản 2 Điều 8 Nghị định số 94/2014/NĐ-CP ngày 17/10/2014 của Chính phủ đứng chân trên địa bàn; UBND cấp xã tổ chức thu Quỹ các đối tượng được quy định tại khoản 3 Điều 8 Nghị định số 94/2014/NĐ-CP đứng chân trên địa bàn và nộp vào tài khoản cấp huyện. Về quản lý thu, Thủ trưởng tổ chức kinh tế hạch toán độc lập có trách nhiệm nộp Quỹ theo định mức được quy định tại khoản 1 Điều 5 Nghị định số 94/2014/NĐ-CP; Thủ trưởng cơ quan, tổ chức có trách nhiệm thu của cán bộ, công chức, viên chức, người lao động, cán bộ, nhân viên trong lực lượng vũ trang thuộc phạm vi quản lý; UBND cấp xã tổ chức thu của các đối tượng lao động khác trên địa bàn (trừ các đối tượng đã thu trên). Cá nhân nộp một lần trước 30/5 hằng năm; tổ chức kinh tế hạch toán độc lập nộp tối thiểu 50% số phải nộp trước 30/5, số còn lại nộp trước 30/10 hằng năm.
Quỹ dùng để chi hỗ trợ cho các hoạt động phòng, chống thiên tai, như: Cứu trợ, hỗ trợ khắc phục hậu quả thiên tai; hỗ trợ các hoạt động ứng phó thiên tai; hỗ trợ các hoạt động phòng ngừa; hỗ trợ chi thù lao cho người trực tiếp đi thu và các chi phí hành chính phát sinh liên quan đến công tác thu Quỹ tại cấp xã; được điều chuyển để hỗ trợ các địa phương khác bị thiệt hại do thiên tai vượt quá khả năng khắc phục của địa phương.
Chủ tịch UBND tỉnh quyết định mức chi và nội dung chi cho các đối tượng theo đề nghị của Ban Chỉ huy phòng, chống thiên tai và tìm kiếm cứu nạn tỉnh; Ban Chỉ huy PCTT và tìm kiếm cứu nạn tỉnh có trách nhiệm tổng hợp thiệt hại và nhu cầu hỗ trợ của UBND cấp huyện và các cơ quan, tổ chức liên quan, đề xuất trình Chủ tịch UBND tỉnh; căn cứ vào số thu Quỹ thực tế, Chủ tịch UBND tỉnh quyết định việc xuất Quỹ hỗ trợ cho các địa phương khác....
Quy chế này có hiệu lực thi hành kể từ ngày ký.